مصرف کوتاه‌مدت آنتی‌بیوتیک‌ها می‌تواند به مقاومت در برابر آنتی‌بیوتیک‌ها در باکتری‌های روده منجر شود و این تغییرات ممکن است مدت‌ها پس از قطع مصرف دارو ادامه یابد.
مصرف داروی سیپروفلوکساسین باعث ایجاد مقاومت آنتی‌بیوتیکی پایدار در باکتری‌های روده انسان می‌شود، به‌طوری‌که این مقاومت مستقلاً در گونه‌های مختلف باکتری ظاهر می‌شود و بیش از ۱۰ هفته دوام می‌آورد.
مقاومت ضدمیکروبی (AMR)، یک نگرانی جهانی در حوزه سلامت، سالانه با میلیون‌ها مرگ مرتبط است. این مقاومت به‌طور گسترده ناشی از مصرف بیش از حد و نامناسب آنتی‌بیوتیک است.
